本文介绍了PYTHON:Scipy的曲线适合NxM阵列?的处理方法,对大家解决问题具有一定的参考价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习吧!
问题描述
我通常使用Scipy.Optimize.curveFit来使定制函数适合数据。 这种情况下的数据始终是一维数组。
二维数组有类似的函数吗? 举个例子,我有一个10x10的数值数组。然后我有一个函数,它执行一些操作并创建一个10x10数值数组,我希望对该函数进行拟合,以便得到的10x10数组最适合输入数组。
也许举个例子更好:)
data = pyfits.getdata('data.fits') #fits is an image format, this gives me a NxM numpy array
mod1 = pyfits.getdata('mod1.fits')
mod2 = pyfits.getdata('mod2.fits')
mod3 = pyfits.getdata('mod3.fits')
mod1_1D = numpy.ravel(mod1)
mod2_1D = numpy.ravel(mod2)
mod3_1D = numpy.ravel(mod3)
def dostuff(a,b): #originaly this is a function for 2D arrays
newdata = (mod1_1D*12)+(mod2_1D)**a - mod3_1D/b
return newdata
现在应该安装a和b,以便新数据尽可能接近数据。
到目前为止我得到的:
data1D = numpy.ravel(data)
data_X = numpy.arange(data1D.size)
fit = curve_fit(dostuff,data_X,data1D)
但印刷品只适合我
(array([ 1.]), inf)
我的阵列中确实有一些nan,也许这是一个问题?
推荐答案
目标是将2D函数表示为一维函数:g(x, y, ...) --> f(xy, ...)
(x, y)
转换为单个数字xy
乍看起来可能很棘手。但实际上这很简单。只需枚举所有数据点,您就有一个唯一定义每个坐标对的数字。拟合后的函数只需重建原始坐标,进行计算并返回结果。
适合20x10图像中的二维线性渐变的示例:
import scipy as sp
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
n, m = 10, 20
# noisy example data
x = np.arange(m).reshape(1, m)
y = np.arange(n).reshape(n, 1)
z = x + y * 2 + np.random.randn(n, m) * 3
def f(xy, a, b):
i = xy // m # reconstruct y coordinates
j = xy % m # reconstruct x coordinates
out = i * a + j * b
return out
xy = np.arange(z.size) # 0 is the top left pixel and 199 is the top right pixel
res = sp.optimize.curve_fit(f, xy, np.ravel(z))
z_est = f(xy, *res[0])
z_est2d = z_est.reshape(n, m)
plt.subplot(2, 1, 1)
plt.plot(np.ravel(z), label='original')
plt.plot(z_est, label='fitted')
plt.legend()
plt.subplot(2, 2, 3)
plt.imshow(z)
plt.xlabel('original')
plt.subplot(2, 2, 4)
plt.imshow(z_est2d)
plt.xlabel('fitted')
这篇关于PYTHON:Scipy的曲线适合NxM阵列?的文章就介绍到这了,希望我们推荐的答案对大家有所帮助,也希望大家多多支持编程学习网!
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