本文介绍了如何使用PYSPARK从Spark获得批次行的处理方法,对大家解决问题具有一定的参考价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习吧!
问题描述
我有一个包含60多亿行数据的Spark RDD,我想使用Train_on_Batch来训练深度学习模型。我不能将所有行都放入内存中,所以我希望一次获得10K左右的内存,以批处理成64或128个的块(取决于型号大小)。我目前使用的是rdd.Sample(),但我认为这不能保证我会得到所有行。有没有更好的方法来划分数据,使其更易于管理,这样我就可以编写一个生成器函数来获取批处理?我的代码如下:
data_df = spark.read.parquet(PARQUET_FILE)
print(f'RDD Count: {data_df.count()}') # 6B+
data_sample = data_df.sample(True, 0.0000015).take(6400)
sample_df = data_sample.toPandas()
def get_batch():
for row in sample_df.itertuples():
# TODO: put together a batch size of BATCH_SIZE
yield row
for i in range(10):
print(next(get_batch()))
推荐答案
我不相信Spark会让您对数据进行偏移或分页。
但您可以添加索引,然后对其进行分页,首先:
from pyspark.sql.functions import lit
data_df = spark.read.parquet(PARQUET_FILE)
count = data_df.count()
chunk_size = 10000
# Just adding a column for the ids
df_new_schema = data_df.withColumn('pres_id', lit(1))
# Adding the ids to the rdd
rdd_with_index = data_df.rdd.zipWithIndex().map(lambda (row,rowId): (list(row) + [rowId+1]))
# Creating a dataframe with index
df_with_index = spark.createDataFrame(chunk_rdd,schema=df_new_schema.schema)
# Iterating into the chunks
for chunk_size in range(0,count+1 ,chunk_size):
initial_page = page_num*chunk_size
final_page = initial_page + chunk_size
where_query = ('pres_id > {0} and pres_id <= {1}').format(initial_page,final_page)
chunk_df = df_with_index.where(where_query).toPandas()
train_on_batch(chunk_df) # <== Your function here
这不是最佳方案,因为使用了 pandas 数据帧,它会严重利用Spark,但会解决您的问题。
如果这会影响您的功能,请不要忘记删除ID。
这篇关于如何使用PYSPARK从Spark获得批次行的文章就介绍到这了,希望我们推荐的答案对大家有所帮助,也希望大家多多支持编程学习网!
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